Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd5P13379 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd5P13379 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd5P13379 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd5P13379 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd5P13379 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms