Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Calb1P12658 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Calb1P12658 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Calb1P12658 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Calb1P12658 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calb1P12658 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calb1P12658 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calb1P12658 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms