Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spp1P10923 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spp1P10923 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spp1P10923 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spp1P10923 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spp1P10923 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spp1P10923 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spp1P10923 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms