Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl2P10148 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl2P10148 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl2P10148 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms