Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Schip1P0DPB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Schip1P0DPB4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Schip1P0DPB4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms