Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb8P09632 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb8P09632 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb8P09632 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb8P09632 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms