Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxb3P09026 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxb3P09026 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxb3P09026 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxb3P09026 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms