Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt13P08730 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt13P08730 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt13P08730 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt13P08730 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt13P08730 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt13P08730 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms