Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NeflP08551 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NeflP08551 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NeflP08551 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NeflP08551 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NeflP08551 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NeflP08551 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NeflP08551 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NeflP08551 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NeflP08551 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NeflP08551 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NeflP08551 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NeflP08551 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NeflP08551 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NeflP08551 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NeflP08551 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NeflP08551 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NeflP08551 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeflP08551 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NeflP08551 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NeflP08551 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NeflP08551 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NeflP08551 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NeflP08551 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NeflP08551 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeflP08551 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeflP08551 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeflP08551 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeflP08551 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NeflP08551 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeflP08551 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeflP08551 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeflP08551 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeflP08551 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NeflP08551 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NeflP08551 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeflP08551 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeflP08551 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NeflP08551 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NeflP08551 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeflP08551 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeflP08551 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeflP08551 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NeflP08551 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms