Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Me1P06801 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Me1P06801 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Me1P06801 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Me1P06801 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Me1P06801 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Me1P06801 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Me1P06801 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Me1P06801 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Me1P06801 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Me1P06801 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Me1P06801 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Me1P06801 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Me1P06801 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Me1P06801 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Me1P06801 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Me1P06801 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Me1P06801 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Me1P06801 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Me1P06801 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Me1P06801 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Me1P06801 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Me1P06801 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Me1P06801 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Me1P06801 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Me1P06801 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Me1P06801 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Me1P06801 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Me1P06801 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Me1P06801 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Me1P06801 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Me1P06801 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Me1P06801 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Me1P06801 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Me1P06801 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Me1P06801 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms