Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01794 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01794 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01794 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01794 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01794 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01794 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01794 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01794 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01794 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01794 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01794 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01794 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01794 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01794 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01794 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01794 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01794 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01794 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01794 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01794 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms