Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01725 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01725 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01725 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01725 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01725 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01725 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01725 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01725 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01725 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01725 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01725 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01725 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01725 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01725 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01725 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01725 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01725 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01725 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01725 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01725 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01725 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01725 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01725 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01725 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01725 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms