Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01647 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01647 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01647 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01647 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01647 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01647 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01647 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01647 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01647 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01647 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01647 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01647 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01647 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01647 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01647 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01647 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01647 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01647 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P01647 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P01647 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01647 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01647 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01647 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01647 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01647 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01647 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01647 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01647 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
P01647 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01647 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01647 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P01647 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01647 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01647 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01647 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01647 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01647 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01647 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01647 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01647 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01647 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01647 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01647 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01647 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01647 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01647 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01647 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01647 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01647 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01647 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P01647 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01647 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01647 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01647 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01647 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01647 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01647 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01647 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P01647 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms