Protein–RNA interactions for Protein: P01639

Gm5571, Ig kappa chain V-V region MOPC 41, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5571P01639 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5571P01639 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5571P01639 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5571P01639 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5571P01639 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5571P01639 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5571P01639 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms