Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4bP01029 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4bP01029 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4bP01029 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4bP01029 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4bP01029 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4bP01029 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4bP01029 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4bP01029 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4bP01029 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4bP01029 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4bP01029 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4bP01029 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4bP01029 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4bP01029 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4bP01029 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4bP01029 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4bP01029 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4bP01029 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4bP01029 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4bP01029 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4bP01029 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4bP01029 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4bP01029 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4bP01029 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4bP01029 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C4bP01029 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4bP01029 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C4bP01029 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4bP01029 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4bP01029 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4bP01029 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C4bP01029 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C4bP01029 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4bP01029 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4bP01029 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C4bP01029 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4bP01029 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4bP01029 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C4bP01029 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C4bP01029 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C4bP01029 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4bP01029 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4bP01029 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4bP01029 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C4bP01029 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4bP01029 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4bP01029 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4bP01029 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4bP01029 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C4bP01029 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4bP01029 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C4bP01029 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C4bP01029 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C4bP01029 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4bP01029 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4bP01029 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C4bP01029 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C4bP01029 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4bP01029 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C4bP01029 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4bP01029 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C4bP01029 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4bP01029 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4bP01029 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4bP01029 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C4bP01029 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4bP01029 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4bP01029 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4bP01029 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C4bP01029 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C4bP01029 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C4bP01029 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4bP01029 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4bP01029 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C4bP01029 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4bP01029 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C4bP01029 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms