Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odc1P00860 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odc1P00860 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odc1P00860 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odc1P00860 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odc1P00860 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Odc1P00860 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Odc1P00860 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms