Protein–RNA interactions for Protein: O88967

Yme1l1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yme1l1O88967 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yme1l1O88967 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yme1l1O88967 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yme1l1O88967 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yme1l1O88967 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms