Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ShdO88834 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ShdO88834 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ShdO88834 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ShdO88834 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ShdO88834 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ShdO88834 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ShdO88834 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ShdO88834 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ShdO88834 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ShdO88834 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ShdO88834 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ShdO88834 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ShdO88834 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ShdO88834 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ShdO88834 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShdO88834 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ShdO88834 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ShdO88834 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ShdO88834 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ShdO88834 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ShdO88834 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ShdO88834 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ShdO88834 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ShdO88834 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ShdO88834 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ShdO88834 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ShdO88834 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ShdO88834 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ShdO88834 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ShdO88834 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ShdO88834 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ShdO88834 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ShdO88834 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ShdO88834 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ShdO88834 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ShdO88834 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms