Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema3fO88632 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sema3fO88632 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema3fO88632 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema3fO88632 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms