Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aff1O88573 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff1O88573 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aff1O88573 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms