Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnmt3aO88508 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnmt3aO88508 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnmt3aO88508 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms