Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sorl1O88307 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sorl1O88307 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sorl1O88307 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms