Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cfdp1O88271 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfdp1O88271 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfdp1O88271 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfdp1O88271 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms