Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChadO55226 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChadO55226 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChadO55226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChadO55226 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChadO55226 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChadO55226 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChadO55226 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChadO55226 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChadO55226 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ChadO55226 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ChadO55226 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ChadO55226 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ChadO55226 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms