Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngr2O55101 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngr2O55101 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms