Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SlkO54988 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SlkO54988 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SlkO54988 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SlkO54988 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SlkO54988 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SlkO54988 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SlkO54988 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SlkO54988 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SlkO54988 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SlkO54988 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SlkO54988 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SlkO54988 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SlkO54988 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SlkO54988 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SlkO54988 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SlkO54988 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SlkO54988 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SlkO54988 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SlkO54988 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SlkO54988 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SlkO54988 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SlkO54988 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SlkO54988 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SlkO54988 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SlkO54988 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SlkO54988 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SlkO54988 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SlkO54988 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SlkO54988 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SlkO54988 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SlkO54988 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SlkO54988 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SlkO54988 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SlkO54988 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SlkO54988 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlkO54988 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlkO54988 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlkO54988 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlkO54988 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SlkO54988 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SlkO54988 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SlkO54988 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SlkO54988 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SlkO54988 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SlkO54988 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SlkO54988 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SlkO54988 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SlkO54988 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SlkO54988 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SlkO54988 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SlkO54988 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SlkO54988 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SlkO54988 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SlkO54988 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms