Protein–RNA interactions for Protein: O54897

Gpr27, Probable G-protein coupled receptor 27, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr27O54897 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr27O54897 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr27O54897 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr27O54897 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr27O54897 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr27O54897 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpr27O54897 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpr27O54897 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms