Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Srpk2O54781 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Srpk2O54781 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Srpk2O54781 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Srpk2O54781 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Srpk2O54781 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Srpk2O54781 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Srpk2O54781 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Srpk2O54781 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms