Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdc4O35988 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdc4O35988 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdc4O35988 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms