Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf5O35326 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf5O35326 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf5O35326 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srsf5O35326 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Srsf5O35326 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf5O35326 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf5O35326 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srsf5O35326 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srsf5O35326 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf5O35326 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf5O35326 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf5O35326 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms