Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5294J3QP53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms