Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fmo6J3QMN6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fmo6J3QMN6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fmo6J3QMN6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmo6J3QMN6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms