Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm3J3QMI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm3J3QMI4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm3J3QMI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calhm3J3QMI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Calhm3J3QMI4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calhm3J3QMI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Calhm3J3QMI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms