Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms