Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OpcmlG5E8G3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OpcmlG5E8G3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
OpcmlG5E8G3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OpcmlG5E8G3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms