Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms