Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab11fip2G3XA57 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab11fip2G3XA57 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab11fip2G3XA57 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab11fip2G3XA57 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms