Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmigd3G3X8R9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmigd3G3X8R9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmigd3G3X8R9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmigd3G3X8R9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms