Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
BicraF8VPZ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
BicraF8VPZ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
BicraF8VPZ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
BicraF8VPZ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
BicraF8VPZ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
BicraF8VPZ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
BicraF8VPZ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
BicraF8VPZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms