Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zc3h7bF8VPP8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zc3h7bF8VPP8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zc3h7bF8VPP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zc3h7bF8VPP8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms