Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3443F7CCV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3443F7CCV5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms