Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Gm28048F7BCN0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gm28048F7BCN0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gm28048F7BCN0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gm28048F7BCN0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm28048F7BCN0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Gm28048F7BCN0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Gm28048F7BCN0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Gm28048F7BCN0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm28048F7BCN0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Gm28048F7BCN0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm28048F7BCN0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28048F7BCN0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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