Protein–RNA interactions for Protein: F6QKH6

Lipo5, Lipase, member O5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo5F6QKH6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lipo5F6QKH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lipo5F6QKH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lipo5F6QKH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms