Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp17lbE9Q9U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp17lbE9Q9U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp17lbE9Q9U0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp17lbE9Q9U0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lbE9Q9U0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lbE9Q9U0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp17lbE9Q9U0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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