Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc146E9Q9F7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc146E9Q9F7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms