Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
6030445D17RikE9Q8F9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
6030445D17RikE9Q8F9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms