Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrp3E9Q1T6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrp3E9Q1T6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms