Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4931408C20RikE9PWP9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
4931408C20RikE9PWP9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4931408C20RikE9PWP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4931408C20RikE9PWP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms