Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Trappc8E9PWG2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Trappc8E9PWG2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Trappc8E9PWG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Trappc8E9PWG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms