Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AU019823E9PUQ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AU019823E9PUQ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AU019823E9PUQ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AU019823E9PUQ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms