Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Soga1E1U8D0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Soga1E1U8D0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Soga1E1U8D0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Soga1E1U8D0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Soga1E1U8D0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms